PySDM es una interfaz para publicar las configuraciones del archivo fstab (/etc/fstab). En este archivo es posible especificar las particiones que se automontan al inicio, crear reglas udev dinámicas, entre otras cosas.
Instalación
Instalar PySDM es muy sencillo en Ubuntu:
sudo apt-get install pysdm
Otras distribuciones populares cuentan con pysdm en sus repositorios oficiales. Claro, siempre queda la posibilidad de descargarse el código fuente.
Uso
Antes de empezar, es una buena sentido hacer un backup del archivo fstab:
sudo cp /etc/fstab /etc/fstab.old
Luego, sólo hay que ejecutar el Storage Device Manager (pysdm). Podés hacerlo desde un terminal ejecutando…
gksu pysdm
… luego, seleccioná la partición que quieras auto-montar y hacé clic en el botón Assistant:

Pysdm en acción.
Para una partición EXT, ésta suele subsistir una configuración típica:

Opciones típicas para una partición EXT
Para una partición NTFS, en cambio, las mejores opciones son las siguientes (en especial, asegurate de que «Mount file system in read-only mode» se encuentre deshabilitada):

Opciones típicas para una partición NTFS
Una vez que termines de ajustar las configuraciones según tus gustos y necesidades, hacé clic en el botón OK y luego en el botón Apply.
Seguí las mismas instrucciones para cada partición que quieras auto-montar al inicio. Asegurate de presionar siempre Apply al finalizar.
En acontecimiento de que hayas metido la pata, podés restaurar el archivo fstab manuscrito con el siguiente comando:
sudo cp /etc/fstab.old /etc/fstab

